Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramel1Q99MW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramel1Q99MW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramel1Q99MW3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms