Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS7

Ehbp1l1, EH domain-binding protein 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehbp1l1Q99MS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ehbp1l1Q99MS7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ehbp1l1Q99MS7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ehbp1l1Q99MS7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ehbp1l1Q99MS7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms