Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrapQ99MP8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BrapQ99MP8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms