Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CalcbQ99MP3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CalcbQ99MP3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CalcbQ99MP3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CalcbQ99MP3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CalcbQ99MP3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CalcbQ99MP3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CalcbQ99MP3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms