Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atp1b4Q99ME6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b4Q99ME6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b4Q99ME6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b4Q99ME6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b4Q99ME6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms