Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms