Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms