Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnpo2Q99LG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms