Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RtcbQ99LF4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms