Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1aQ99L02 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms