Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms