Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab28Q99KL7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab28Q99KL7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms