Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep3Q99KK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms