Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dok4Q99KE3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Dok4Q99KE3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dok4Q99KE3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms