Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp11Q99K46 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp11Q99K46 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp11Q99K46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms