Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufsp2Q99K23 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufsp2Q99K23 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms