Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TirapQ99JY1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TirapQ99JY1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms