Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxf1Q99JX7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxf1Q99JX7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms