Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddb2Q99J79 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms