Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms