Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1l1Q923U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms