Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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