Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Clip1Q922J3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms