Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Sh3bp4Q921I6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp4Q921I6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Sh3bp4Q921I6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Sh3bp4Q921I6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Sh3bp4Q921I6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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