Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf3Q920N1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms