Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms