Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atpaf2Q91YY4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atpaf2Q91YY4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms