Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm2Q91YD4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm2Q91YD4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm2Q91YD4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm2Q91YD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm2Q91YD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trpm2Q91YD4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm2Q91YD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm2Q91YD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms