Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcdha12Q91Y18 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms