Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlrp6Q91WS2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp6Q91WS2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp6Q91WS2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms