Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csde1Q91W50 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csde1Q91W50 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms