Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klc3Q91W40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klc3Q91W40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms