Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crb1Q8VHS2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crb1Q8VHS2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms