Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot6lQ8VEG6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6lQ8VEG6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6lQ8VEG6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms