Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgip1Q8VD37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms