Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zcchc18Q8VD24 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms