Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
0610009B22RikQ8R3W2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms