Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tut1Q8R3F9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tut1Q8R3F9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tut1Q8R3F9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms