Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab11fip5Q8R361 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms