Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms