Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2A5

Vmn1r225, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r225Q8R2A5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r225Q8R2A5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r225Q8R2A5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms