Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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