Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms