Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b4Q8QZY9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms