Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms