Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MyripQ8K3I4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms