Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms