Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms