Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a8Q8JZR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms