Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-Q4Q8HWB2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms